Jump to content
Dogomania

Współczynnik inbredu


Cockerek

Recommended Posts

W temacie 'genetyczne linki" podany był link na kalkulator obliczajcy współczynnik inbredu. No i sobie policzyłam i wyszło mi 25,78%. Problem w tym że nie umiem tego wyniku odczytać. Tzn. dużo jak na inbred czy średnio czy jak?
Aha, no i wyszło że od strony matki 75% a od ojca 50%, co te wyniki oznaczają tak naprawdę???

Link to comment
Share on other sites

Wynik ponad 25% to wysoka wartośc wsp. inbredu. Oznacza on najprosciej ujmując, że psiak jest w 25% homozygotyczny (czyli ma identyczne kopie genów w danym locus). Nie zapominaj jednak, że sa to tylko wyliczenia teoretyczne: nigdy nie wiemy jak przebiega segregacja genów w kom. rozrodczych, co oznacza, że rzeczywisty poziom jednorodności genetycznej może byc jeszce większy, ale równie dobrze mniejszy.
Warto również zauwazyć, że program ten nie jest zbyt dokładny, ponieważ ogranicza sie tylko do 4 pokoleń wstecz. Co prawda im dalszy przodek tym jego udział w zwiększeniu stopnia inbredu jest mniejszy, ale zawsze...

Link to comment
Share on other sites

Dzięki wielkie :P
Mam w związku z tym jeszcze jedno pytanie: czy warto/można kontynuować inbred na tej linii, jeśli inbred ten okazał się... nie wiem jak to określić... udany :roll: ? Czy jednak współczynnik mógłby być w tym wpadku już za wysoki? Oczywiście to tylko liczby i rachunki, ale ciekawi mnie to. Jak sądzicie?

Patka, juz pędzę na twoją stronę :P

Link to comment
Share on other sites

Jeśli inbred daje pozytywne efekty - inbredować dalej!
Trudno mówić o konkretnej granicy, przy której należy zaniechać inbredowania. Wszystko zależy od efektów - jeśli nie ma spadku odporności, nie pojawiają się kłopoty w rozrodzia, można kontynuować inbred. Wszak zawierzęta laboratoryjne hoduje się w niemalże 100%inbredzie (kojarząc rodzeństwo przez dziesiątki pokoleń, jest nawet linia selekcjonowana tak przez ponad 115 pokoleń!).
Aby uniknąć ew. negatywnych skutków, można inbredować na linnię a nie jednego przodka. Wtedy współczynnik inbredy narasta wolniej, ale i efekty mogą byc mniej wyraźne...

Link to comment
Share on other sites

  • 2 years later...

Spróbuję to przedstawić tak prosto jak się tylko da.
Ale nie w jednym poście ;)

Na początek trochę teori :

[B]Wspó[/B][B]łczynnik inbredu[/B] to prawdopodobieństwo, że 2 allele( wersje genu np.A,a, B...) w losowo wybranym locus(miejscu) pochodzą od wspólnego przodka i s[FONT=Arial][FONT=Arial Narrow][FONT=Arial Black][FONT=Verdana]ą [FONT=ArialMT]identyczne.[/FONT][/FONT][/FONT][/FONT][/FONT]

[LEFT][FONT=Arial][FONT=Arial Narrow][FONT=Arial Black][FONT=Verdana][FONT=ArialMT][SIZE=3][SIZE=2][FONT=ArialMT]Współczynnik inbredu [/FONT][FONT=ArialMT]okre[/FONT][FONT=ArialMT]ś[/FONT][FONT=ArialMT]la, w jakim stopniu wzro[/FONT][FONT=ArialMT]ś[/FONT][FONT=ArialMT]nie homozygotyczno[/FONT][FONT=ArialMT]ść [/FONT][FONT=ArialMT]osobnika w stosunku do [/FONT][FONT=ArialMT]ś[/FONT][FONT=ArialMT]redniej homozygotyczno[/FONT][FONT=ArialMT]ś[/FONT][FONT=ArialMT][SIZE=3][SIZE=2]ci[/SIZE] [SIZE=2]w populacji.[/SIZE][/SIZE][/FONT][/SIZE][/SIZE][/FONT][/FONT][/FONT][/FONT][/FONT]

[/LEFT]
[FONT=Arial][FONT=Arial Narrow][FONT=Arial Black][FONT=Verdana][SIZE=3][/SIZE][/FONT][/FONT][/FONT][/FONT]
[LEFT][B]Spokrewnienie w lini prostej[/B] to takie gdy jedno zwierze jest przodkiem drugiego czyli ojciec - dziadek- pradziadek...[/LEFT]

[LEFT][B]Spokrewnienie w lini bocznej[/B] to takie gdy para osobników posiada wsólnego przodka np. półsiostry.[/LEFT]

[LEFT]Czy jak na razie wszystkie terminy są zrozumiałe?
Czy trzeba tłumaczyć co oznacza homozygotyczność?[/LEFT]

Link to comment
Share on other sites

[quote name='Toller']Jeśli chodzi o teorię to kumam bez problemu - dla mnie istotne jest jak obliczyć COI, i do ilu pokoleń wstecz się go na ogół oblicza.[/quote]
zajrzałaś do mojego [url="http://czerwonytrop.com/inb/index.php?full=ok&lng=pl"]linku[/url]? Podaje COI, AVK i rozkład procentowy genów przodków.
Oblicza się dla tylu ile znasz, im więcej tym lepiej. Przy wyniku podaje się dla ilu pokoleń jest obliczony, bo różnice bywają znaczne.

Link to comment
Share on other sites

Join the conversation

You can post now and register later. If you have an account, sign in now to post with your account.

Guest
Reply to this topic...

×   Pasted as rich text.   Paste as plain text instead

  Only 75 emoji are allowed.

×   Your link has been automatically embedded.   Display as a link instead

×   Your previous content has been restored.   Clear editor

×   You cannot paste images directly. Upload or insert images from URL.

×
×
  • Create New...